Apparaten voor zwaveldenitrificatie zetten opgeloste minerale stoffen (ammonium, nitrieten en nitraten) om in gas (stikstofgas), een van de belangrijkste componenten van lucht. Het stikstofgas komt vrij in de atmosfeer. Biofilters zetten organisch materiaal om in opgeloste minerale stoffen. De enige gassen die tijdens dit proces worden uitgestoten, zijn de gassen die worden geproduceerd door de respiratie van aerobe bacteriën (CO2). De hardheid van zeewater bedraagt ongeveer 14 Franse graden. Er is een lege ruimte aan de onderkant van de filters, waardoor het water door de filterkaarsen kan circuleren (een soort zeef die niet in contact mag komen met het zand), evenals een lege ruimte aan de bovenkant, waardoor de filters teruggespoeld kunnen worden zonder zand te verliezen. Met het zand erin, en zonder het gewicht van het water mee te rekenen, weegt elk filter ongeveer 17 ton. Elke dag wordt het grote aquarium bijgevuld met 1% vers zeewater. Het verse zeewater wordt niet gesteriliseerd (het bevat zeer weinig micro-organismen). Het wordt echter wel opnieuw van zuurstof voorzien en het gehalte aan opgeloste elementen wordt opnieuw in evenwicht gebracht voordat het over de verschillende circuits wordt verdeeld. Nadat het verse zeewater opnieuw van zuurstof is voorzien, wordt het over een specifiek substraat geleid dat het meeste ijzer en mangaan vasthoudt, maar voldoende overlaat voor de behoeften van dieren en planten. Een deel ervan wordt verzameld als droog poeder en verwerkt door een gespecialiseerd bedrijf. Een deel ervan gaat terug naar de zee. Merk op dat de watercircuits van de twee tentoonstellingen niet met elkaar verbonden zijn. De tentoonstelling ‘Over kusten en mensen’ beschikt over 11 onafhankelijke waterbehandelingscircuits (8 voor zeewater en 3 voor zoet water); de tentoonstelling ‘Op volle zee’ heeft 2 circuits, beide voor zeewater. Het vermogen van de agitatoren kan onafhankelijk worden aangepast, als dit nuttig zou zijn voor de levenscyclus van de dieren. De bioballen zijn gemaakt van gerecycleerd plastic. Er kan ook gerecycleerd worden gebruikt, maar dat is veel zwaarder en dan zouden er veel dikkere betonnen reservoirs voor nodig zijn geweest. Deze bioballen zijn zelfreinigend vanwege het langzame mengeffect dat wordt verkregen door de geïnjecteerde luchtbellen. Het water in het grote aquarium wordt mechanisch gefilterd, verwarmd, belucht, gesteriliseerd (U.V.) en gezuiverd in biofilters (door micro-organismen), een skimmer en denitrificatie-apparaten. Het terugspoelwater van de mechanische filters wordt gerecycleerd en kan, afhankelijk van onze behoeften, naar het grote aquarium worden gevoerd. Het gedecanteerde slib wordt gerecycleerd en verder verwerkt door een erkend bedrijf. Het water in de grote tank wordt zes keer per dag volledig gefilterd en 1% van het volume wordt na zuivering teruggevoerd naar de zee.